水源熱泵和空氣源熱泵這兩種設備，都有各自的優點，沒有哪一種好的說法。還是要看自己的需求和當地的狀況來考量，但可以根據以下三點進行參考:
一、原理不同
空氣源熱泵是由電機驅動，利用空氣中的能量作為低溫熱源，經過冷凝器或蒸發器進行熱交換，然后通過循環系統，在建筑物內提取或釋放熱量，滿足用戶加溫或制冷需求。
水源熱泵是利用電功去提取地下水的熱源/冷源，為建筑物進行供暖或制冷。
二、它們的優點
空氣源熱泵是熱泵加熱，水電分離，不會對環境造成影響、綠色環保，也不用擔心制冷劑的泄漏導致環境污染；使用較靈活、沒有太多限制，相比電采暖每月可以節省55﹪左右的電費。
水源熱泵優勢在于地下水溫度一年四季相對穩定，波動小，COP值高達5以上，在產生同樣制冷或加溫效果的同時，水源熱泵比空調要省電30﹪-40﹪左右。水源熱泵的主機不與空氣換熱，只需放置在建筑物通風良好的地方。
三、它們的缺點
空氣源熱泵的能量源自空氣中的熱能，所以在-10℃或溫度更低的環境中，空氣中熱能減少，能轉換的熱能也就隨之減少，工作效能會變差，進而影響機組的整體運作。
水源熱泵打井埋管受場地限制比較大，必須有足夠的面積用于打井和埋管，同時也需要當地有充足的地下水可以滿足機組運行所需出水量。
